Autor: Helm, Mark / Organisationseinheit: FB 09 Chemie, Pharmazie, Geographie und Geowissenschaften

1. In-Depth Immune-Oncology Studies of the Tumor Microenvironment in a Humanized Melanoma Mouse Model

Autoren:: Schupp, Jonathan; Christians, Arne; Zimmer, Niklas; Gleue, Lukas; Jonuleit, Helmut; Helm, Mark; Tuettenberg, Andrea
Veröffentlichungsdatum:: 2021
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

2. Experience with German Research Consortia in the Field of Chemical Biology of Native Nucleic Acid Modifications

Autoren:: Helm, Mark; Bohnsack, Markus T; Carell, Thomas; Dalpke, Alexander; Entian, Karl-Dieter; Ehrenhofer-Murray, Ann; Ficner, Ralf; Hammann, Christian; Ho''bartner, Claudia; Ja''schke, Andres; Jeltsch, Albert; Kaiser, Stefanie; Klassen, Roland; Leidel, Sebastian A; Marx, Andreas; Mo''rl, Mario; Meier, Jochen C; Meister, Gunter; Rentmeister, Andrea; Rodnina, Marina; Roignant, Jean-Yves; Schaffrath, Raffael; Stadler, Peter; Stafforst, Thorsten
Veröffentlichungsdatum:: 2023
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

3. NanopoReaTA: a user-friendly tool for nanopore-seq real-time transcriptional analysis

Autoren:: Wierczeiko, Anna; Pastore, Stefan; Muendnich, Stefan; Busch, Anne M; Dietrich, Vincent; Helm, Mark; Butto, Tamer; Gerber, Susanne
Editoren:: Mathelier, Anthony
Veröffentlichungsdatum:: 2023
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

4. Variability of Substrate Specificity of Serum Antibodies Obtained from Patients with Different Autoimmune and Viral Diseases in Reaction of tRNA Hydrolysis.

Autoren:: Vlassov, Alexander V; Helm, Mark; Florentz, Catherine; Naumov, Valery A; Breusov, Alexander A; Buneva, Valentina N; Giege, Richard; Nevinsky, Georgy A
Veröffentlichungsdatum:: 1999
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

5. Quantification of substoichiometric modification reveals global tsRNA hypomodification, preferences for angiogenin-mediated tRNA cleavage, and idiosyncratic epitranscriptomes of human neuronal cell-lines

Autoren:: Pichot, Florian; Hogg, Marion C; Marchand, Virginie; Bourguignon, Valerie; Jirstrom, Elisabeth; Farrell, Cliona; Gibriel, Hesham A; Prehn, Jochen HM; Motorin, Yuri; Helm, Mark
Veröffentlichungsdatum:: 2023
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

6. Phosphorylation found inside RNA

Autoren:: Helm, Mark; Motorin, Yuri
Veröffentlichungsdatum:: 2022
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

7. Therapeutic melanoma inhibition by local micelle-mediated cyclic nucleotide repression

Autoren:: Johann, Kerstin; Bohn, Toszka; Shahneh, Fatemeh; Luther, Natascha; Birke, Alexander; Jaurich, Henriette; Helm, Mark; Klein, Matthias; Raker, Verena K; Bopp, Tobias; Barz, Matthias; Becker, Christian
Veröffentlichungsdatum:: 2021
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

8. Non-Redundant tRNA Reference Sequences for Deep Sequencing Analysis of tRNA Abundance and Epitranscriptomic RNA Modifications

Autoren:: Pichot, Florian; Marchand, Virginie; Helm, Mark; Motorin, Yuri
Veröffentlichungsdatum:: 2021
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

9. HITS-CLIP analysis of human ALKBH8 points towards its role in tRNA and noncoding RNA regulation

Autoren:: Cavallin, Ivana; Bartošovič, Marek; Skalický, Tomas; Rengaraj, Praveenkumar; Schmidt-Dengler, Martina Christina; Drino, Aleksej; Helm, Mark; Vaňáčová, Štěpánka
Veröffentlichungsdatum:: 2022
Typ:: Preprint

10. The Effect of tRNA[Ser]Sec Isopentenylation on Selenoprotein Expression

Autoren:: Fradejas-Villar, Noelia; Bohleber, Simon; Zhao, Wenchao; Reuter, Uschi; Kotter, Annika; Helm, Mark; Knoll, Rainer; McFarland, Robert; Taylor, Robert W; Mo, Yufeng; Miyauchi, Kenjyo; Sakaguchi, Yuriko; Suzuki, Tsutomu; Schweizer, Ulrich
Veröffentlichungsdatum:: 2021
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

11. Gene Amplification-Associated Overexpression of the Selenoprotein tRNA Enzyme TRIT1 Confers Sensitivity to Arsenic Trioxide in Small-Cell Lung Cancer

Autoren:: Coll-SanMartin, Laia; Davalos, Veronica; Pineyro, David; Rossello-Tortella, Margalida; Bueno-Costa, Alberto; Setien, Fernando; Villanueva, Alberto; Granada, Isabel; Ruiz-Xiviller, Neus; Kotter, Annika; Helm, Mark; Yokota, Jun; Kawabata-Iwakawa, Reika; Kohno, Takashi; Esteller, Manel
Veröffentlichungsdatum:: 2021
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

12. Kti12, a PSTK-like tRNA dependent ATPase essential for tRNA modification by Elongator

Autoren:: Krutyholowa, Roscislaw; Hammermeister, Alexander; Zabel, Rene; Abdel-Fattah, Wael; Reinhardt-Tews, Annekathrin; Helm, Mark; Stark, Michael JR; Breunig, Karin D; Schaffrath, Raffael; Glatt, Sebastian
Veröffentlichungsdatum:: 2019
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

13. Analysis of the Cellular Roles of MOCS3 Identifies a MOCS3-Independent Localization of NFS1 at the Tips of the Centrosome

Autoren:: Neukranz, Yannika; Kotter, Annika; Beilschmidt, Lena; Marelja, Zvonimir; Helm, Mark; Graf, Ralph; Leimkuehler, Silke
Veröffentlichungsdatum:: 2019
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

14. Methods for RNA Modification Mapping Using Deep Sequencing: Established and New Emerging Technologies

Autoren:: Motorin, Yuri; Helm, Mark
Veröffentlichungsdatum:: 2019
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

15. Monitoring drug nanocarriers in human blood by near-infrared fluorescence correlation spectroscopy

Autoren:: Negwer, Inka; Best, Andreas; Schinnerer, Meike; Schaefer, Olga; Capeloa, Leon; Wagner, Manfred; Schmidt, Manfred; Mailaender, Volker; Helm, Mark; Barz, Matthias; Butt, Hans-Juergen; Koynov, Kaloian
Veröffentlichungsdatum:: 2018
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

16. Double methylation of tRNA-U54 to 2′-O-methylthymidine (Tm) synergistically decreases immune response by Toll-like receptor 7

Autoren:: Keller, Patrick; Freund, Isabel; Marchand, Virginie; Bec, Guillaume; Huang, Raven; Motorin, Yuri; Eigenbrod, Tatjana; Dalpke, Alexander; Helm, Mark
Veröffentlichungsdatum:: 2018
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

17. High-Throughput Mapping of 2'-O-Me Residues in RNA Using Next-Generation Sequencing (Illumina RiboMethSeq Protocol)

Autoren:: Marchand, Virginie; Ayadi, Lilia; El Hajj, Aseel; Blanloeil-Oillo, Florence; Helm, Mark; Motorin, Yuri
Veröffentlichungsdatum:: 2017
Typ:: Kapitel

18. A Vastly Increased Chemical Variety of RNA Modifications Containing a Thioacetal Structure

Autoren:: Dal Magro, Christina; Keller, Patrick; Kotter, Annika; Werner, Stephan; Duarte, Victor; Marchand, Virginie; Ignarski, Michael; Freiwald, Anja; Mueller, Roman-Ulrich; Dieterich, Christoph; Motorin, Yuri; Butter, Falk; Atta, Mohamed; Helm, Mark
Veröffentlichungsdatum:: 2018
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

19. A multifunctional bioconjugate module for versatile photoaffinity labeling and click chemistry of RNA

Autoren:: Kellner, Stefanie; Seidu-Larry, Salifu; Burhenne, Jürgen; Motorin, Yuri; Helm, Mark
Veröffentlichungsdatum:: 2011
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

20. Comprehensive DNA methylation analysis of the Aedes aegypti genome

Autoren:: Falckenhayn, Cassandra; Carneiro, Vitor Coutinho; Amarante, Anderson de Mendonca; Schmid, Katharina; Hanna, Katharina; Kang, Seokyoung; Helm, Mark; Dimopoulos, George; Fantappie, Marcelo Rosado; Lyko, Frank
Veröffentlichungsdatum:: 2016
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

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