Datenquelle: DBLP and Web of Science (Lite) - Universitätsbibliographie Suchergebnisse

1. Iterative beam search for car sequencing

Autoren:: Golle, Uli; Rothlauf, Franz; Boysen, Nils
Veröffentlichungsdatum:: 2015
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

2. Car sequencing versus mixed-model sequencing : a computational study

Autoren:: Golle, Uli; Rothlauf, Franz; Boysen, Nils
Veröffentlichungsdatum:: 2014
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

3. Model-Based Decision Support in Manufacturing and Service Networks

Autoren:: Fink, Andreas; Kliewer, Natalia; Mattfeld, Dirk; Moench, Lars; Rothlauf, Franz; Schryen, Guido; Suhl, Leena; Voss, Stefan
Veröffentlichungsdatum:: 2014
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

4. Analysis and design of sequencing rules for car sequencing

Autoren:: Golle, Uli; Boysen, Nils; Rothlauf, Franz
Veröffentlichungsdatum:: 2010
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

5. On the bias and performance of the edge-set encoding

Autoren:: Rothlauf, Franz
Veröffentlichungsdatum:: 2009
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

6. Evolution strategies, network random keys, and the one-max tree problem

Autoren:: Schindler, B; Rothlauf, F; Pesch, HJ
Editoren:: Cagnoni, Stefano; Gottlieb, Jens; Hart, Emma; Middendorf, Martin; Raidl, Günther R
Veröffentlichungsdatum:: 2002
Typ:: Konferenzbeitrag

7. PageRank centrality for performance prediction : the impact of the local optima network model

Autoren:: Herrmann, Sebastian; Ochoa, Gabriela; Rothlauf, Franz
Veröffentlichungsdatum:: 2018
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

8. Combinator-Based Fixpoint Algorithms for Big-Step Abstract Interpreters

Autoren:: Keidel, Sven; Erdweg, Sebastian; Hombuecher, Tobias
Veröffentlichungsdatum:: 2023
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

9. The Influence of Social Curiosity on the Observing Behavior of Users on Social Network Sites

Autoren:: Ernst, Claus-Peter H; Pfeiffer, Jella; Rothlauf, Franz
Veröffentlichungsdatum:: 2015
Typ:: Konferenzbeitrag

10. Representations for Evolutionary Algorithms

Autoren:: Rothlauf, Franz
Editoren:: Fieldsend, Jonathan E; Wagner, Markus
Veröffentlichungsdatum:: 2022
Typ:: Konferenzbeitrag

11. Virtualized HPC : a contradiction in terms?

Autoren:: Birkenheuer, Georg; Brinkmann, André; Kaiser, Jürgen; Keller, Axel; Keller, Matthias; Kleineweber, Christoph; Konersmann, Christoph; Niehörster, Oliver; Schäfer, Thorsten; Simon, Jens; Wilhelm, Maximilian
Veröffentlichungsdatum:: 2012
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

12. Balls into bins with related random choices

Autoren:: Berenbrink, Petra; Brinkmann, André; Friedetzky, Tom; Nagel, Lars
Veröffentlichungsdatum:: 2012
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

13. Cube Connected Cycles based Bluetooth scatternet formation

Autoren:: Bienkowski, Marcin; Brinkmann, André; Korzeniowski, Miroslaw; Orhan, Orhan
Editoren:: Lorenz, Pascal; Dini, Petre
Veröffentlichungsdatum:: 2005
Typ:: Konferenzbeitrag

14. Content distribution in heterogenous video-on-Demand P2P networks with ARIMA forecasts

Autoren:: Loeser, Christoph; Schomaker, Gunnar; Brinkmann, André; Vodisek, Mario; Heidebuer, Michael
Editoren:: Lorenz, Pascal
Veröffentlichungsdatum:: 2005
Typ:: Konferenzbeitrag

15. Anycasting in adversarial systems : routing and admission control

Autoren:: Awerbuch, Baruch; Brinkmann, André; Scheideler, Christian
Editoren:: Baeten, Jos CM
Veröffentlichungsdatum:: 2003
Typ:: Konferenzbeitrag

16. An Analysis of Flash Page Reuse With WOM Codes

Autoren:: Yadgar, Gala; Yaakobi, Eitan; Margaglia, Fabio; Li, Yue; Yucovich, Alexander; Bundak, Nachum; Gilon, Lior; Yakovi, Nir; Schuster, Assaf; Brinkmann, Andre
Veröffentlichungsdatum:: 2018
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

17. Smart Grid-aware scheduling in data centres

Autoren:: Mäsker, Markus; Nagel, Lars; Brinkmann, André; Lotfifar, Foad; Johnson, Matthew
Veröffentlichungsdatum:: 2016
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

18. LoneStar RAID: Massive Array of Offline Disks for Archival Systems

Autoren:: Grawinkel, Matthias; Nagel, Lars; Brinkmann, Andre
Veröffentlichungsdatum:: 2016
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

19. Building a medical research cloud in the EASI-CLOUDS project

Autoren:: Wu, Jie; Narayanan, Krishnaprasad; Nagel, Lars; Fiehe, Christoph; Litvina, Anna; Tonn, Jakob; Zoth, Carsten; Goltz, Hans-Joachim; Unger, Steffen; Pursche, Fabian; Scheel, Michael; Brinkmann, André; Thronicke, Wolfgang
Veröffentlichungsdatum:: 2015
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

20. Quantum chemical meta-workflows in MoSGrid

Autoren:: Herres-Pawlis, Sonja; Hoffmann, Alexander; Balaské, Ákos; Kacsuk, Péter; Birkenheuer, Georg; Brinkmann, André; Garza, Luis de la; Krüger, Jens; Gesing, Sandra; Grunzke, Richard; Terstyánszky, Gábor; Weingarten, Noam
Veröffentlichungsdatum:: 2015
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

21. SAUCE: A web application for interactive teaching and learning of parallel programming

Autoren:: Hundt, Christian; Schlarb, Moritz; Schmidt, Bertil
Veröffentlichungsdatum:: 2017
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

22. Undirected postman problems with zigzagging option: A cutting-plane approach

Autoren:: Irnich, Stefan
Veröffentlichungsdatum:: 2008
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

23. In-depth analysis of pricing problem relaxations for the capacitated arc-routing problem

Autoren:: Bode, Claudia; Irnich, Stefan
Veröffentlichungsdatum:: 2015
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

24. Solving elementary shortest-path problems as mixed-integer programs

Autoren:: Drexl, Michael; Irnich, Stefan
Veröffentlichungsdatum:: 2014
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

25. Formulations for an inventory routing problem

Autoren:: Archetti, Claudia; Bianchessi, Nicola; Irnich, Stefan; Speranza, M Grazia
Veröffentlichungsdatum:: 2014
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

26. A new branch-and-price algorithm for the traveling tournament problem

Autoren:: Irnich, Stefan
Veröffentlichungsdatum:: 2010
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

27. MTGP: Combining Metamorphic Testing and Genetic Programming

Autoren:: Sobania, Dominik; Briesch, Martin; Roechner, Philipp; Rothlauf, Franz
Veröffentlichungsdatum:: 2023
Typ:: Kapitel

28. Comprehension and comprehensibility of popular science texts: the research project PopSci - Understanding Science

Autoren:: Wolfer, Sascha; Held, Uli; Hansen-Schirra, Silvia
Veröffentlichungsdatum:: 2015
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

29. Gute Ergebnisse aus "schlechten" Textvorlagen. Einflüsse der OCR-Qualität auf kulturwissenschaftsgeschichtliche Forschungsergebnisse am Beispiel von Drucken des 18. Jahrhunderts

Autoren:: Klein, Elisabeth; Däumer, Matthias; Hütig, Andreas
Veröffentlichungsdatum:: 2016
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

30. An encoding in metaheuristics for the minimum communication spanning Tree problem

Autoren:: Rothlauf, Franz
Veröffentlichungsdatum:: 2009
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

31. Solving the skiving stock problem by a combination of stabilized column generation and the Reflect Arc-Flow model

Autoren:: Korbacher, Laura; Irnich, Stefan; Martinovic, John; Strasdat, Nico
Veröffentlichungsdatum:: 2023
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

32. Temptation and commitment in the laboratory

Autoren:: Houser, Daniel; Schunk, Daniel; Winter, Joachim; Xiao, Erte
Veröffentlichungsdatum:: 2018
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

33. rapidGSEA: Speeding up gene set enrichment analysis on multi-core CPUs and CUDA-enabled GPUs

Autoren:: Hundt, Christian; Hildebrandt, Andreas; Schmidt, Bertil
Veröffentlichungsdatum:: 2016
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

34. SWMapper: Scalable Read Mapper on SunWay TaihuLight

Autoren:: Xu, Kai; Duan, Xiaohui; Meng, Xiangxu; Li, Xin; Schmidt, Bertil; Liu, Weiguo
Editoren:: Amaral, José Nelson; John, Lizy Kurian; Shen, Xipeng
Veröffentlichungsdatum:: 2020
Typ:: Konferenzbeitrag

35. Local search for vehicle routing and scheduling problems:: Review and conceptual integration

Autoren:: Funke, B; Grünert, T; Irnich, S
Veröffentlichungsdatum:: 2005
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

36. Variable Fixing for Two-Arc Sequences in Branch-Price-and-Cut Algorithms on Path-Based Models

Autoren:: Desaulniers, Guy; Gschwind, Timo; Irnich, Stefan
Veröffentlichungsdatum:: 2020
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

37. SAUCE: A Web-Based Automated Assessment Tool for Teaching Parallel Programming

Autoren:: Schlarb, Moritz; Hundt, Christian; Schmidt, Bertil
Editoren:: Hunold, Sascha; Costan, Alexandru; Giménez, Domingo; Iosup, Alexandru; Ricci, Laura; Requena, María Engracia Gómez; Scarano, Vittorio; Varbanescu, Ana Lucia; Scott, Stephen L; Lankes, Stefan; Weidendorfer, Josef; Alexander, Michael
Veröffentlichungsdatum:: 2015
Typ:: Konferenzbeitrag

38. Does the Intra-Arctic Modification of Long-Range Transported Aerosol Affect the Local Radiative Budget? (A Case Study)

Autoren:: Nakoudi, Konstantina; Ritter, Christoph; Boeckmann, Christine; Kunkel, Daniel; Eppers, Oliver; Rozanov, Vladimir; Mei, Linlu; Pefanis, Vasileios; Jaekel, Evelyn; Herber, Andreas; Maturilli, Marion; Neuber, Roland
Veröffentlichungsdatum:: 2020
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

39. Performability Evaluation and Optimization of Workflow Applications in Cloud Environments

Autoren:: Oliveira, Danilo; Brinkmann, Andre; Rosa, Nelson; Maciel, Paulo
Veröffentlichungsdatum:: 2019
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

40. Zeroing memory deallocator to reduce checkpoint sizes in virtualized HPC environments

Autoren:: Gad, Ramy; Pickartz, Simon; Suss, Tim; Nagel, Lars; Lankes, Stefan; Monti, Antonello; Brinkmann, Andre
Veröffentlichungsdatum:: 2018
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

41. Simulation and Performance Analysis of the ECMWF Tape Library System

Autoren:: Masker, Markus; Nagel, Lars; Suess, Tim; Brinkmann, Andre; Sorth, Lennart
Editoren:: West, John; Pancake, Cherri M
Veröffentlichungsdatum:: 2016
Typ:: Konferenzbeitrag

42. On the Role of Non-effective Code in Linear Genetic Programming

Autoren:: Dal Piccol Sotto, Leo Francoso; Rothlauf, Franz
Editoren:: Auger, Anne; Stützle, Thomas
Veröffentlichungsdatum:: 2019
Typ:: Konferenzbeitrag

43. On the Disadvantages of Rented Software with Regard to Psychological Ownership in the Context of Private Customers

Autoren:: Weitzel, Dirk; Ernst, Claus-Peter H; Rothlauf, Franz
Editoren:: Anderson, Bonnie Brinton; Thatcher, Jason; Meservy, Rayman D; Chudoba, Kathy; Fadel, Kelly J; Brown, Sue
Veröffentlichungsdatum:: 2020
Typ:: Konferenzbeitrag

44. Representations for Evolutionary Algorithms

Autoren:: Rothlauf, Franz
Editoren:: López-Ibáñez, Manuel; Auger, Anne; Stützle, Thomas
Veröffentlichungsdatum:: 2019
Typ:: Konferenzbeitrag

45. Predicting Heuristic Search Performance with PageRank Centrality in Local Optima Networks

Autoren:: Herrmann, Sebastian; Rothlauf, Franz
Editoren:: Silva, Sara; Esparcia-Alcázar, Anna Isabel
Veröffentlichungsdatum:: 2015
Typ:: Konferenzbeitrag

46. Integrating keyword advertising and dynamic pricing for an online market place

Autoren:: Goertz, Thomas; Pfeiffer, Jella; Schmidt, Henning; Rothlauf, Franz
Editoren:: Huisman, Dennis
Veröffentlichungsdatum:: 2014
Typ:: Konferenzbeitrag

47. Efficiency Improvement of DC* through a Genetic Guidance

Autoren:: Castiello, Ciro; Mencar, Corrado; Lucarelli, Marco; Rothlauf, Franz
Veröffentlichungsdatum:: 2017
Typ:: Konferenzbeitrag

48. Strategies and Influencing Factors for Big Data Exploration

Autoren:: Bremser, Christian; Piller, Gunther; Rothlauf, Franz
Veröffentlichungsdatum:: 2017
Typ:: Konferenzbeitrag

49. Representations for Evolutionary Algorithms

Autoren:: Rothlauf, Franz
Editoren:: Ryan, Conor; Keijzer, Maarten
Veröffentlichungsdatum:: 2017
Typ:: Konferenzbeitrag

50. Shaping Communities of Local Optima by Perturbation Strength

Autoren:: Herrmann, Sebastian; Herrmann, Matthias; Ochoa, Gabriela; Rothlauf, Franz
Editoren:: Bosman, Peter AN
Veröffentlichungsdatum:: 2017
Typ:: Konferenzbeitrag

51. Representations for Evolutionary Algorithms

Autoren:: Rothlauf, Franz
Editoren:: Friedrich, Tobias; Neumann, Frank; Sutton, Andrew M
Veröffentlichungsdatum:: 2016
Typ:: Konferenzbeitrag

52. An Implicitly Parallel EDA Based on Restricted Boltzmann Machines

Autoren:: Probst, Melte; Rothlauf, Franz; Grahl, Joern
Editoren:: Arnold, Dirk V
Veröffentlichungsdatum:: 2014
Typ:: Konferenzbeitrag

53. On the Bias of Syntactic Geometric Recombination in Genetic Programming and Grammatical Evolution

Autoren:: Thorhauer, Ann; Rothlauf, Franz
Editoren:: Silva, Sara; Esparcia-Alcázar, Anna Isabel
Veröffentlichungsdatum:: 2015
Typ:: Konferenzbeitrag

54. Optimization of Reactive Force Field Simulation: Refactor, Parallelization, and Vectorization for Interactions

Autoren:: Gao, Ping; Duan, Xiaohui; Schmidt, Bertil; Zhang, Wusheng; Gan, Lin; Fu, Haohuan; Xue, Wei; Liu, Weiguo; Yang, Guangwen
Veröffentlichungsdatum:: 2022
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

55. Millimeter-Scale and Billion-Atom Reactive Force Field Simulation on Sunway Taihulight

Autoren:: Gao, Ping; Duan, Xiaohui; Zhang, Tingjian; Zhang, Meng; Schmidt, Bertil; Zhang, Xun; Sun, Hongliang; Zhang, Wusheng; Gan, Lin; Xue, Wei; Fu, Haohuan; Liu, Weiguo; Yang, Guangwen
Veröffentlichungsdatum:: 2020
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

56. Combining GPU and FPGA Technology for Efficient Exhaustive Interaction Analysis in GWAS

Autoren:: Kaessens, Jan Christian; Wienbrandt, Lars; Schimmler, Manfred; Gonzalez-Dominguez, Jorge; Schmidt, Bertil
Veröffentlichungsdatum:: 2016
Typ:: Konferenzbeitrag

57. MSAProbs-MPI: parallel multiple sequence aligner for distributed-memory systems

Autoren:: Gonzalez-Dominguez, Jorge; Liu, Yongchao; Tourino, Juan; Schmidt, Bertil
Veröffentlichungsdatum:: 2016
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

58. kmcEx: memory-frugal and retrieval-efficient encoding of counted k-mers

Autoren:: Jiang, Peng; Luo, Jie; Wang, Yiqi; Deng, Pingji; Schmidt, Bertil; Tang, Xiangjun; Chen, Ningjiang; Wong, Limsoon; Zhao, Liang
Editoren:: Berger, Bonnie
Veröffentlichungsdatum:: 2019
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

59. Massively Parallel ANS Decoding on GPUs

Autoren:: Weissenberger, Andre; Schmidt, Bertil
Veröffentlichungsdatum:: 2019
Typ:: Konferenzbeitrag

60. Fast and efficient short read mapping based on a succinct hash index

Autoren:: Zhang, Haowen; Chan, Yuandong; Fan, Kaichao; Schmidt, Bertil; Liu, Weiguo
Veröffentlichungsdatum:: 2018
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

61. mD3DOCKxb: An Ultra-Scalable CPU-MIC Coordinated Virtual Screening Framework

Autoren:: Peng, Shaoliang; Zhang, Xiaoyu; Yang, Shunyun; Su, Wenhe; Zhang, Zhiqiang; Dong, Dong; Lu, Kai; Lu, Yutong; Liao, Xiangke; Schmidt, Bertil; Zhu, Weiliang; Li, Kuan-Ching
Veröffentlichungsdatum:: 2017
Typ:: Konferenzbeitrag

62. SWhybrid: A Hybrid-Parallel Framework for Large-Scale Protein Sequence Database Search

Autoren:: Lan, Haidong; Liu, Weiguo; Liu, Yongchao; Schmidt, Bertil
Veröffentlichungsdatum:: 2017
Typ:: Konferenzbeitrag

63. S-Aligner: Ultrascalable read mapping on Sunway Taihu Light

Autoren:: Duan, Xiaohui; Xu, Kai; Chan, Yuandong; Liu, Weiguo; Hundt, Christian; Schmidt, Bertil; Balaji, Pavan
Veröffentlichungsdatum:: 2017
Typ:: Konferenzbeitrag

64. Mapping of option pricing algorithms onto heterogeneous many-core architectures

Autoren:: Zhang, Shuai; Wang, Zhao; Peng, Ying; Schmidt, Bertil; Liu, Weiguo
Veröffentlichungsdatum:: 2017
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

65. CLOVE: classification of genomic fusions into structural variation events

Autoren:: Schroder, Jan; Wirawan, Adrianto; Schmidt, Bertil; Papenfuss, Anthony T
Veröffentlichungsdatum:: 2017
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

66. Bio-ESMD: A Data Centric Implementation for Large-Scale Biological System Simulation on Sunway TaihuLight Supercomputer

Autoren:: Duan, Xiaohui; Shao, Qi; Weng, Junben; Schmidt, Bertil; Gan, Lin; Li, Guohui; Fu, Haohuan; Xue, Wei; Liu, Weiguo; Yang, Guangwen
Veröffentlichungsdatum:: 2023
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

67. Redesigning and Optimizing UCSF DOCK3.7 on Sunway TaihuLight

Autoren:: Xu, Kai; Zhang, Jinxiao; Duan, Xiaohui; Wan, Xiaobo; Huang, Niu; Schmidt, Bertil; Liu, Weiguo; Yang, Guangwen
Veröffentlichungsdatum:: 2022
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

68. Accelerating JPEG Decompression on GPUs

Autoren:: Weissenberger, Andre; Schmidt, Bertil
Veröffentlichungsdatum:: 2021
Typ:: Konferenzbeitrag

69. Cell-List based Molecular Dynamics on Many-Core Processors: A Case Study on Sunway TaihuLight Supercomputer

Autoren:: Duan, Xiaohui; Gao, Ping; Zhang, Meng; Zhang, Tingjian; Meng, Hongsong; Li, Yuxuan; Schmidt, Bertil; Fu, Haohuan; Gan, Lin; Xue, Wei; Liu, Weiguo; Yang, Guangwen
Editoren:: Cuicchi, Christine; Qualters, Irene; Kramer, William T
Veröffentlichungsdatum:: 2020
Typ:: Konferenzbeitrag

70. A generic parallel pattern-based system for bioinformatics

Autoren:: Liu, WG; Schmidt, B
Editoren:: Danelutto, Marco; Vanneschi, Marco; Laforenza, Domenico
Veröffentlichungsdatum:: 2004
Typ:: Konferenzbeitrag

71. Parallel algorithms for large-scale biological sequence alignment on Xeon-Phi based clusters

Autoren:: Lan, Haidong; Chan, Yuandong; Xu, Kai; Schmidt, Bertil; Peng, Shaoliang; Liu, Weiguo
Veröffentlichungsdatum:: 2016
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

72. Parallel and Space-Efficient Construction of Burrows-Wheeler Transform and Suffix Array for Big Genome Data

Autoren:: Liu, Yongchao; Hankeln, Thomas; Schmidt, Bertil
Veröffentlichungsdatum:: 2016
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

73. Accelerating Large-Scale Biological Database Search on Xeon Phi-based Neo-Heterogeneous Architectures

Autoren:: Lan, Haidong; Liu, Weiguo; Schmidt, Bertil; Wang, Bingqiang
Editoren:: Huan, Jun; Miyano, Satoru; Shehu, Amarda; Hu, Xiaohua Tony; Ma, Bin; Rajasekaran, Sanguthevar; Gombar, Vijay K; Schapranow, Matthieu-P; Yoo, Illhoi; Zhou, Jiayu; Chen, Brian; Pai, Vinay; Pierce, Brian G
Veröffentlichungsdatum:: 2015
Typ:: Konferenzbeitrag

74. SNVSniffer: an integrated caller for germline and somatic single-nucleotide and indel mutations

Autoren:: Liu, Yongchao; Loewer, Martin; Aluru, Srinivas; Schmidt, Bertil
Veröffentlichungsdatum:: 2016
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

75. Bit-parallel approximate pattern matching: Kepler GPU versus Xeon Phi

Autoren:: Tuan, Tu Tran; Liu, Yongchao; Schmidt, Bertil
Veröffentlichungsdatum:: 2016
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

76. A Parallel Algorithm for Error Correction in High-Throughput Short-Read Data on CUDA-Enabled Graphics Hardware

Autoren:: Shi, Haixiang; Schmidt, Bertil; Liu, Weiguo; Mueller-Wittig, Wolfgang
Veröffentlichungsdatum:: 2010
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

77. Constructing large suffix trees on a computational grid

Autoren:: Chen, Chunxi; Schmidt, Bertil
Veröffentlichungsdatum:: 2006
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

78. Parallel pattern-based systems for computational biology: A case study

Autoren:: Liu, Weiguo; Schmidt, Bertil
Veröffentlichungsdatum:: 2006
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

79. Accelerating the Viterbi algorithm for Profile Hidden Markov Models using reconfigurable hardware

Autoren:: Oliver, Timothy F; Schmidt, Bertil; Jakop, Yanto; Maskell, Douglas L
Editoren:: Alexandrov, Vassil N; Albada, G Dick van; Sloot, Peter MA; Dongarra, Jack J
Veröffentlichungsdatum:: 2006
Typ:: Konferenzbeitrag

80. Multi-objective evolutionary algorithm for discovering peptide binding motifs

Autoren:: Rajapakse, Menaka; Schmidt, Bertil; Brusic, Vladimir
Editoren:: Rothlauf, Franz; Branke, Jürgen; Cagnoni, Stefano; Costa, Ernesto; Cotta, Carlos; Drechsler, Rolf; Lutton, Evelyne; Machado, Penousal; Moore, Jason H; Romero, Juan; Smith, George D; Squillero, Giovanni; Takagi, Hideyuki
Veröffentlichungsdatum:: 2006
Typ:: Konferenzbeitrag

81. Parallel RNA secondary structure prediction using stochastic context-free grammars

Autoren:: Liu, T; Schmidt, B
Veröffentlichungsdatum:: 2005
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

82. Reconfigurable architectures for bio-sequence database scanning on FPGAs

Autoren:: Oliver, TF; Schmidt, B; Maskell, DL
Veröffentlichungsdatum:: 2005
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

83. Design of a parallel accelerator for volume rendering

Autoren:: Schmidt, B
Editoren:: Bode, Arndt; Ludwig, Thomas; Karl, Wolfgang; Wismüller, Roland
Veröffentlichungsdatum:: 2000
Typ:: Konferenzbeitrag

84. A parallel accelerator architecture for multimedia video compression

Autoren:: Schmidt, B; Schimmler, M
Editoren:: Amestoy, Patrick; Berger, Philippe; Daydé, Michel J; Duff, Iain S; Frayssé, Valérie; Giraud, Luc; Ruiz, Daniel
Veröffentlichungsdatum:: 1999
Typ:: Konferenzbeitrag

85. Long operand arithmetic on instruction systolic computer architectures and its application in RSA cryptography

Autoren:: Schmidt, B; Schimmler, M; Schröder, H
Editoren:: Pritchard, David J; Reeve, Jeff
Veröffentlichungsdatum:: 1998
Typ:: Konferenzbeitrag

86. Efficient and Accurate OTU Clustering with GPU-Based Sequence Alignment and Dynamic Dendrogram Cutting

Autoren:: Thuy-Diem, Nguyen; Schmidt, Bertil; Zheng, Zejun; Kwoh, Chee-Keong
Veröffentlichungsdatum:: 2015
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

87. Large-scale genome-wide association studies on a GPU cluster using a CUDA-accelerated PGAS programming model

Autoren:: Gonzalez-Dominguez, Jorge; Kaessens, Jan Christian; Wienbrandt, Lars; Schmidt, Bertil
Veröffentlichungsdatum:: 2015
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

88. Faster GPU-Accelerated Smith-Waterman Algorithm with Alignment Backtracking for Short DNA Sequences

Autoren:: Liu, Yongchao; Schmidt, Bertil
Editoren:: Wyrzykowski, Roman; Dongarra, Jack J; Karczewski, Konrad; Wasniewski, Jerzy
Veröffentlichungsdatum:: 2014
Typ:: Konferenzbeitrag

89. CUDA-Accelerated Alignment of Subsequences in Streamed Time Series Data

Autoren:: Hundt, Christian; Schmidt, Bertil; Schoemer, Elmar
Veröffentlichungsdatum:: 2014
Typ:: Konferenzbeitrag

90. FPGA-based acceleration of detecting statistical epistasis in GWAS

Autoren:: Wienbrandt, Lars; Kaessens, Jan Christian; Gonzalez-Dominguez, Jorge; Schmidt, Bertil; Ellinghaus, David; Sehimmler, Manfred
Editoren:: Abramson, David; Lees, Michael; Krzhizhanovskaya, Valeria V; Dongarra, Jack J; Sloot, Peter MA
Veröffentlichungsdatum:: 2014
Typ:: Konferenzbeitrag

91. CUSHAW2-GPU: Empowering Faster Gapped Short-Read Alignment Using GPU Computing

Autoren:: Liu, Yongchao; Schmidt, Bertil
Veröffentlichungsdatum:: 2014
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

92. Iterative sparse matrix-vector multiplication for accelerating the block Wiedemann algorithm over GF(2) on multi-graphics processing unit systems

Autoren:: Schmidt, Bertil; Aribowo, Hans; Hoang-Vu, Dang
Veröffentlichungsdatum:: 2013
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

93. A hybrid short read mapping accelerator

Autoren:: Chen, Yupeng; Schmidt, Bertil; Maskell, Douglas L
Veröffentlichungsdatum:: 2013
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

94. CUDA-BLASTP: Accelerating BLASTP on CUDA-Enabled Graphics Hardware

Autoren:: Liu, Weiguo; Schmidt, Bertil; Mueller-Wittig, Wolfgang
Veröffentlichungsdatum:: 2011
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

95. DecGPU: distributed error correction on massively parallel graphics processing units using CUDA and MPI

Autoren:: Liu, Yongchao; Schmidt, Bertil; Maskell, Douglas L
Veröffentlichungsdatum:: 2011
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

96. CompleteMOTIFs: DNA motif discovery platform for transcription factor binding experiments

Autoren:: Kuttippurathu, Lakshmi; Hsing, Michael; Liu, Yongchao; Schmidt, Bertil; Maskell, Douglas L; Lee, Kyungjoon; He, Aibin; Pu, William T; Kong, Sek Won
Veröffentlichungsdatum:: 2011
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

97. CUDA-MEME: Accelerating motif discovery in biological sequences using CUDA-enabled graphics processing units

Autoren:: Liu, Yongchao; Schmidt, Bertil; Liu, Weiguo; Maskell, Douglas L
Veröffentlichungsdatum:: 2010
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

98. MPI-HMMER-Boost: Distributed FPGA acceleration

Autoren:: Walters, John Paul; Meng, Xiandong; Chaudhary, Vipin; Oliver, Tim; Yeow, Leow Yuan; Nathan, Darran; Schmidt, Bertil; Landman, Joseph
Veröffentlichungsdatum:: 2007
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

99. Performance analysis of general-purpose computation on commodity graphics hardware:: A case study using bioinformatics

Autoren:: Liu, Weiguo; Mueller-Wittig, Wolfgang; Schmidt, Bertil
Veröffentlichungsdatum:: 2007
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

100. Streaming algorithms for biological sequence alignment on GPUs

Autoren:: Liu, Weiguo; Schmidt, Bertil; Voss, Gerrit; Mueller-Wittig, Wolfgang
Veröffentlichungsdatum:: 2007
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

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