Autor: Liu, Yongchao / Organisationseinheit: High Performance Computing - Universitätsbibliographie Suchergebnisse

Neu anfangen Autor Liu, Yongchao Organisationseinheit High Performance Computing

1. CUDASW++: optimizing Smith-Waterman sequence database searches for CUDA-enabled graphics processing units

Autoren:: Liu, Yongchao; Maskell, Douglas L; Schmidt, Bertil
Veröffentlichungsdatum:: 2009
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

2. An Ultrafast Scalable Many-Core Motif Discovery Algorithm for Multiple GPUs

Autoren:: Liu, Yongchao; Schmidt, Bertil; Maskell, Douglas L
Veröffentlichungsdatum:: 2011
Typ:: Konferenzbeitrag

3. SWAPHI: Smith-waterman protein database search on Xeon Phi coprocessors

Autoren:: Liu, Yongchao; Schmidt, Bertil
Veröffentlichungsdatum:: 2014
Typ:: Konferenzbeitrag

4. Mapping of BLASTP Algorithm onto GPU Clusters

Autoren:: Liu, Weiguo; Schmidt, Bertil; Liu, Yongchao; Voss, Gerrit; Mueller-Wittig, Wolfgang
Veröffentlichungsdatum:: 2011
Typ:: Konferenzbeitrag

5. Evaluation of GPU-based Seed Generation for Computational Genomics Using Burrows-Wheeler Transform

Autoren:: Liu, Yongchao; Schmidt, Bertil
Veröffentlichungsdatum:: 2012
Typ:: Konferenzbeitrag

6. Bit-Parallel Approximate Pattern Matching on the Xeon Phi Coprocessor

Autoren:: Tran, Tuan Tu; Schindel, Simon; Liu, Yongchao; Schmidt, Bertil
Veröffentlichungsdatum:: 2014
Typ:: Konferenzbeitrag

7. SNVSniffer: An integrated caller for germline and somatic SNVs based on Bayesian models

Autoren:: Liu, Yongchao; Loewer, Martin; Aluru, Srinivas; Schmidt, Bertil
Editoren:: Huan, Jun; Miyano, Satoru; Shehu, Amarda; Hu, Xiaohua Tony; Ma, Bin; Rajasekaran, Sanguthevar; Gombar, Vijay K; Schapranow, Matthieu-P; Yoo, Illhoi; Zhou, Jiayu; Chen, Brian; Pai, Vinay; Pierce, Brian G
Veröffentlichungsdatum:: 2015
Typ:: Konferenzbeitrag

8. MSAProbs-MPI: parallel multiple sequence aligner for distributed-memory systems

Autoren:: Gonzalez-Dominguez, Jorge; Liu, Yongchao; Tourino, Juan; Schmidt, Bertil
Veröffentlichungsdatum:: 2016
Typ:: Zeitschriftenaufsatz

9. SWhybrid: A Hybrid-Parallel Framework for Large-Scale Protein Sequence Database Search

Autoren:: Lan, Haidong; Liu, Weiguo; Liu, Yongchao; Schmidt, Bertil
Veröffentlichungsdatum:: 2017
Typ:: Konferenzbeitrag

10. Parallel and Space-Efficient Construction of Burrows-Wheeler Transform and Suffix Array for Big Genome Data

Autoren:: Liu, Yongchao; Hankeln, Thomas; Schmidt, Bertil
Veröffentlichungsdatum:: 2016
Typ:: Zeitschriftenaufsatz